骨骼骨龄偏大和偏小的原因很多。骨龄是诊断内分泌疾病的重要指标，其中生长激素、甲状腺激素、性激素水平对骨龄的发育均起重要的作用，生长激素缺乏症的患儿由于生长激素分泌不足，导致生长发育落后，甲状腺功能低下患儿由于甲状腺激素分泌不足而影响小儿的生长发育，其骨化中心的出现时间都会显著延迟，因此会出现骨龄明显落后；相反，性早熟、先天性肾上腺皮质增生的患儿由于性激素水平升高使骨骼发育明显加速，干骺愈合过早，因此骨龄大大超过实足年龄。