较难治愈，但可以通过及时治疗减少发作次数、降低严重程度。

深层巩膜炎因为反复发作，巩膜结构受到实质破坏，又因为每次发作都有或轻或重的并发症，会导致视力下降，治疗的意义在于使炎症安静下来，不继续损害巩膜，保存现有的视力。

因为多数巩膜炎通常为全身免疫性疾病在眼部的表现，因此是否会根治和复发，与患者全身疾病的控制以及免疫功能有关。