商贷已经扣款，而公积金还没扣款的原因就是公积金办理流程的速度要比商贷的速度慢。正常情况下，商贷大概两个星期就可以完成从申请、审批到放款的流程。而公积金贷款的流程则比较慢，一般需要1~3个月的时间才能走完申请、审批、放款的流程。所以就会出现商贷都已经扣款了，而公积金贷款还未扣款的情况。

用户申请了提前还贷，银行不扣款，用户可以直接致电银行的客服热线，咨询具体的情况。如果银行给出的答复是未到扣款时间，用户只要耐心等待自动扣款即可。而银行告知，用户的提前还贷申请被拒了，那么系统是不会发起自动扣款的。

部分贷款提前还贷，需要向银行申请，银行必须同意用户提前还贷，系统才会在规定时间进行扣款。而有提前还贷选项的贷款，直接进行提前还贷即可。