外甥和舅舅有50%的遗传基因。一个家庭中的兄弟姐妹，他们具有相同的血缘和遗传基因，都具有父母的50%血缘关系和遗传基因。

外甥是舅舅姐妹的儿子，外甥和他的妈妈有50%的遗传基因，那么和他的舅舅也有50%的遗传基因。所以外甥和舅舅有50%的基因。