清微派祖师爷是黄舜申。

黄舜申，清微派演教祖师，公元1224年农历八月初五日出生，南宋福建建宁人。字晦伯，法名瞬申。幼而聪慧过人，三教九流无所不通，犹好黄老之学。年十四岁，随父亲黄通真前往广西上任。一日忽然染疾，诸名医用药无效。遂投词于清微派祖师，时任广西宪司使（政法委书记）南真人。

清微派祖师是谁

清微道士为了将自己的道派托之古远，宣称传自元始天尊。陈采《清微仙谱》序云：“其传始于元始，二之为玉晨（大道君）与老君，又再一传，衍而为真元、太华、关令、正一之四派。

十传至昭凝祖元君（名舒），又复合于一。继是八传，至混隐真人南公（名毕道）。…