影片剧情是尔冬升导演构思十年的结晶，剧本经过三年推敲百炼而成。《新宿事件》相信是尔冬升筹备最长时间的一部电影，由于故事的构思到资料搜集到开拍花了十年时间，那是因为这个故事实在太吸引尔冬升，而且不断能够加入一些新情节。

有这个故事构思是早于大概1997到1998年，当时尔冬升看到一本地区性的新杂志在探讨这些问题，有时移居到外地本来是为了更好的生活，但事实并不然，因为本地居民总是不接受外来客。