往来款项项目的清查采用发函询证的方法进行核对，往来款项主要包括应收账款、应付账款、预付账款、预收账款等。

法律依据：《中华人民共和国会计法》 第十条 下列经济业务事项，应当办理会计手续，进行会计核算：

（一）款项和有价证券的收付

（二）财物的收发、增减和使用

（三）债权债务的发生和结算

（四）资本、基金的增减

（五）收入、支出、费用、成本的计算

（六）财务成果的计算和处理

（七）需要办理会计手续、进行会计核算的其他事项。